猪囊尾蚴寄生在猪的部位主要有以下几个：
1.皮下：猪囊尾蚴可以寄生在猪的皮下组织中。这是一种常见的寄生部位，因为皮下组织为囊尾蚴提供了足够的空间和营养，有利于其生长和发育。
2.肌肉：猪囊尾蚴也可以寄生在猪的肌肉组织中。肌肉组织为囊尾蚴提供了丰富的营养来源，有利于其生存和繁殖，而感染囊尾蚴的患猪可见肌肉疼痛、前肢僵硬、跛行和食欲不振等。
3.眼：除了皮下和肌肉，猪囊尾蚴还可以寄生在猪的眼部，尤其是眼结膜下组织，还可以寄生在舌部表层，寄生部位出现豆状肿胀。
4.脑：猪囊尾蚴还可以寄生在猪的脑部，引起患猪神经系统功能的障碍，如出现癫痫和急性脑炎症状，甚至死亡。
5.肠胃：猪囊尾蚴也可以寄生在猪的肠道中和胃部。肠胃为囊尾蚴提供了丰富的营养来源，有利于其生存和繁殖，而患猪常见贫血、消瘦、炸毛等营养不良的表现。
6.肝脏：猪囊尾蚴也可以寄生在猪的肝脏中，病理解剖可见肝脏组织有结节和脓肿。
7.肾脏：猪囊尾蚴还可以寄生在猪的肾脏中，病理解剖可见肾脏及输尿管周围结缔组织增生，并有数量较多的包囊，囊内含虫体。
8.肺脏：猪囊尾蚴寄生在肺脏，会导致患猪呼吸困难，如果寄生在喉头，还会出现声音嘶哑和吞咽困难。
总的来说，猪囊尾蚴的寄生部位非常广泛，几乎可以寄生在猪的各个部位，这为猪囊尾蚴的防治带来了一定的困难。